Under et Viaplay-interview gør Thomas Jørgensen det klart, at han er stærkt irriteret over sit brud med FC København i sommeren 2024, da han skiftede til Viborg FF. Ifølge ham lagde klubben hele ansvaret på hans påståede urimelige krav om spilletid, hvilket stadig generer ham to år senere. Han oplevede en mangel på tillid og en manglende chance for at bevise sig i FCK. Træner Jacob Neestrup udtrykte ærgrelse over tabet, men understregede, at fast spilletid ikke kunne garanteres, og antydede, at Jørgensen måske ikke gav klubben en chance.
